“闇之书事件”（参照魔法少女奈叶A's）的10年后。踏入19歳的高町奈叶、菲特·T·哈洛温、八神疾风三人，怀抱着彼此的友情牵绊、为了追求各自的梦想实现而加入时空管理局，并以一流魔导师的身分活跃。
在此当中，出现了新发现的太古遗产“圣遗晶石”（レリック），以及以此为目标而出现的谜样机械兵器“共鸣拓发者”（ガジェットドローン）。为了迅速对应日后被称为“圣遗晶石事件”的状况，八神疾风考虑到设置能够迅速对应的独立部队的必要性，设立了专责处理与太古遗产关连任务的特殊部队——“机动六课”。
另一边，时间回溯到四年前。昴·中岛在遭到机场火灾卷入而几乎丧命之际，由于奈叶的出现而得救。因为憧憬著如同“自己理想中的形象”一般的奈叶，昴在当晚的满天星空之下，做出了“成为管理局的魔导师”的决定。
四年后，经过一番波折而顺利成为管理局的新进魔导师的昴，与训练校时代的伙伴蒂雅娜·兰斯特共同挑战魔导师的升格试验。于远处凝视著两人考试的，分别是认定两人将成为“机动六课”的明日之星而投以注意的疾风与菲特、还有奈叶。在三人的注视之中，随着宣告试验开始的ReinForce II（统御之力zwei）的声音，拉开了“StrikerS”故事的序幕。
主演：内山夕实,杉田智和,小原好美,茅野爱衣,金元寿子,Lynn,会泽纱弥,高田忧希,鹤冈聪,逢坂良太,田中理惠,诸星堇,上田丽奈,兴津和幸,若山诗音,小山力也
主演：本渡枫,岛崎信长,和泉风花,铃木实里,橘杏咲,白石晴香,上村祐翔,长谷川玲奈,石毛翔弥,菲鲁兹·蓝,大野智敬,渡谷美帆,浦和希,樱井美雪,花泽香菜,速水奖,平川大辅
主演：田中真弓,冈村明美,中井和哉,山口胜平,平田广明,大谷育江,山口由里子,矢尾一树,长岛雄一,池田秀一,古川登志夫,古谷彻,大塚周夫,津嘉山正种,草尾毅,大场真人,宝龟克寿,园部启一,柴田秀胜,中博史,阪口大助,竹内顺子,千叶繁,三石琴乃,挂川裕彦,堀秀行,田中秀幸,大友龙三郎,有本钦隆,大塚明夫,玄田哲章,小山茉美,土井美加,野田顺子,渡边美佐,野上尤加奈,林原惠美,水树奈奈,园崎未惠,西原久美子,久川绫,泽城美雪,池泽春菜,斋藤千和,神谷浩史,浪川大辅,森久保祥太郎,石田彰,高木涉,桧山修之,子安武人,
主演：石见舞菜香,川井田夏海,古川慎,梅原裕一郎,菱川花菜,尼克莱·法拉赫娜兹
主演：菱川花菜,川石奈奈,深见梨加,村濑步,大野智敬,真殿光昭,住友七绘,寺杣昌纪,津田美波,山本和臣
主演：山根希美,大地叶,长绳麻理亚,阿部里果
主演：梶裕贵,川井田夏海,寺泽百花,下野纮,丰永利行,兴津和幸,くまいもとこ,日笠阳子,清水理沙,上田丽奈,松山鹰志
主演：花守由美里,土屋神叶,内田真礼,朴璐美,樱井孝宏,Takahiro,Sakurai,小西克幸,Katsuyuki,Konishi,飞田展男,能登麻美子,Mamiko,Noto,水濑祈,Inori,Minase,石谷春贵,瀬戸芭月
主演：内田雄马,户谷菊之介,石见舞菜香,内田真礼,本渡枫,井上和彦,田丸笃志,竹内良太,斋贺光希,松冈祯丞,桑原由气,茅野爱衣,田中正彦
主演：德井青空,小野友树,诸星堇,立花慎之介,千叶翔也,本渡枫,田村由香里,山本兼平
主演：中山真奈花,前田佳织里,关根明良,大地叶,筱原侑,上坂堇,中村栞奈,若井友希,井口裕香,橘杏咲,长谷川玲奈,仁见纱绫,伊藤彩沙,寺泽百花,明坂聪美,弘松芹香,冲佳苗,花咲心优,大森日雅,朝日奈丸佳,武田罗梨沙多胡,菲鲁兹·蓝,三日尻望,伊濑茉莉也,井上麻里奈,小坂井祐莉绘,井泽诗织,林梨花,藤寺美德,石井未纱,日高范子,小西克幸,稻田彻
主演：内山夕实,杉田智和,小原好美,茅野爱衣,金元寿子,Lynn,会泽纱弥,高田忧希,鹤冈聪,逢坂良太,田中理惠,诸星堇,上田丽奈,兴津和幸,若山诗音,小山力也
主演：田中真弓,冈村明美,中井和哉,山口胜平,平田广明,大谷育江,山口由里子,矢尾一树,长岛雄一,池田秀一,古川登志夫,古谷彻,大塚周夫,津嘉山正种,草尾毅,大场真人,宝龟克寿,园部启一,柴田秀胜,中博史,阪口大助,竹内顺子,千叶繁,三石琴乃,挂川裕彦,堀秀行,田中秀幸,大友龙三郎,有本钦隆,大塚明夫,玄田哲章,小山茉美,土井美加,野田顺子,渡边美佐,野上尤加奈,林原惠美,水树奈奈,园崎未惠,西原久美子,久川绫,泽城美雪,池泽春菜,斋藤千和,神谷浩史,浪川大辅,森久保祥太郎,石田彰,高木涉,桧山修之,子安武人,
主演：福山润,杉田智和,伊藤静,渊上舞,洲崎绫,冈本信彦,逢坂良太,内藤玲,田中美海,矢作纱友里,松浦千惠,佐藤聪美,川边骏,金元寿子,宫下荣治,山谷祥生,水岛大宙,间岛淳司,木村昴,沼仓爱美,斋藤枫子,河原木志穗,日野未步,植田佳奈,浅沼晋太郎,高桥伸也,原泽晃绮,诹访彩花,下妻由幸,藤田咲,绪方惠美,井上喜久子,铃代纱弓,金泽舞,梅原裕一郎,山口胜平,山路和弘,东地宏树,稻田彻
主演：德井青空,小野友树,诸星堇,立花慎之介,千叶翔也,本渡枫,田村由香里,山本兼平
主演：中山真奈花,前田佳织里,关根明良,大地叶,筱原侑,上坂堇,中村栞奈,若井友希,井口裕香,橘杏咲,长谷川玲奈,仁见纱绫,伊藤彩沙,寺泽百花,明坂聪美,弘松芹香,冲佳苗,花咲心优,大森日雅,朝日奈丸佳,武田罗梨沙多胡,菲鲁兹·蓝,三日尻望,伊濑茉莉也,井上麻里奈,小坂井祐莉绘,井泽诗织,林梨花,藤寺美德,石井未纱,日高范子,小西克幸,稻田彻
主演：内田雄马,雨宫天,内山昂辉,小野大辅,武内骏辅,寿美菜子,大地叶,川井田夏海,浦和希,平川大辅,家中宏,浅野麻由美,远藤大智,高垣彩阳
主演：户谷菊之介,长谷川育美,天崎滉平,市道真央,Mao,Ichimichi,樱井孝宏,村田太志,小林裕介,杉田智和,Tomokazu,Sugita,天田益男,津田健次郎
主演：橘杏咲,日高里菜,田村由香里,水树奈奈,植田佳奈,结川麻希,寺川千春,小林爱香,伊藤彩沙,青木阳菜,绪方佑奈,佐藤聴成,野上尤加奈,上坂堇
主演：小野贤章,宫本侑芽,中村悠一,久野美咲,小山力也,本田贵子,岛袋美由利,诹访部顺一
主演：村濑步,三木真一郎,朝井彩加,木村良平,佐藤拓也,柿原彻也,山谷祥生,大河元气,梶原岳人,吉永拓斗,土岐隼一,本渡枫,东山奈央,早见沙织,黑田崇矢,小野大辅,斋贺光希
主演：井口裕香,速水奖,井上和彦,高山南,寺崎裕香,森川智之,井上喜久子,梅原裕一郎,濑户麻沙美,东山奈央,子安武人,前野智昭,田村睦心,狩野翔,三瓶由布子,安野希世乃,中岛爱,小山刚志,折笠富美子,白井悠介,山下诚一郎,宫泽清子,田村由香里,小山茉美,山路和弘,福原克己
主演：釘宮理恵,日野聡
